コロナウイルスについて調べたこと（備忘録）
２０２０年２月から５月半ばくらいまで、コロナウイルス関連で調べたことをまとめておきます。
ここに上げてあるもの以外でも調べたことはあるのですが、記録に残ってない・・・
政府からの情報
厚生労働省の報道発表資料のページ（コロナウイルス関連だけでなく）
新型コロナウイルス(COVID-19)感染症の対応について｜内閣官房新型コロナウイルス感染症対策推進室
（旧ページ 内閣官房ホーム > 新型インフルエンザ等対策ホーム > 新型コロナウイルス感染症の対応について）
横浜市からの情報
そもそもコロナウイルスとは？ 基礎知識補充
新型コロナウイルス感染症について 日本ウイルス学会ホームページ
コロナウイルスはプラス鎖一本鎖のRNAをウイルスゲノムとして有するエンベロープウイルスです。ウイルス粒子は直径 約100－200 nmで、S (スパイク)、M (マトリックス)、E (エンベロープ)の3つの蛋白質で構成されています。
S蛋白質は細胞側の受容体（ウイルス蛋白質を鍵とするとその鍵穴）と結合して、細胞内への侵入に必要な蛋白質です。コロナウイルスのゲノムRNAは約3万塩基とRNAウイルスの中で最長なのが特徴です。
ヒトに感染するコロナウイルスとしては、風邪の原因ウイルスとしてヒトコロナウイルス229E、OC43、NL63、HKU-1の4種類、そして、重篤な肺炎を引き起こす2002年に発生した重症急性呼吸器症候群 (SARS)コロナウイルスと2012年に発生した中東呼吸器症候群 (MERS)コロナウイルスの2種類が知られています。
今回発生している新型コロナウイルスは、SARSコロナウイルスと同じベータコロナウイルス属に分類され、新型コロナウイルスの遺伝子はSARSコロナウイルスの遺伝子と相同性が高く（約80%程度）、さらに、SARSコロナウイルスと同じ受容体 (ACE2)を使ってヒトの細胞に吸着・侵入することが最近の研究で報告されています。
６．予防：
新型コロナウイルスはエンベロープウイルスですのでアルコールなどで感染力を失うことが知られています。必要以上に恐れる必要はありませんが、手洗い・うがい・マスクなどの基本的な感染症予防を行うことが公衆衛生上重要です。
ヒトに感染するコロナウイルス
ヒトに蔓延している風邪のウイルス４種類と、動物から感染する重症肺炎ウイルス２種類が知られている。
・風邪のコロナウイルス
ヒトに日常的に感染する４種類のコロナウイルス（Human Coronavirus：HCoV）は、HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-HKU1である。風邪の10～15％（流行期35％）はこれら4種のコロナウイルスを原因とする。
冬季に流行のピークが見られ、ほとんどの子供は6歳までに感染を経験する。
多くの感染者は軽症だが、高熱を引き起こすこともある。
HCoV-229E、HCoV-OC43が最初に発見されたのは1960年代。
HCoV-NL63とHCoV-HKU1は2000年代に入って新たに発見された。
・動物から感染する重症肺炎ウイルス２種類
重症急性呼吸器症候群コロナウイルス（SARS-CoV）
中東呼吸器症候群コロナウイルス（MERS-CoV）が知られている。
動物コロナウイルス
コロナウイルスは家畜や野生動物などの、我々の周りに棲息するあらゆる動物に感染し、様々な疾患を引き起こすことも知られている。
イヌ、ネコ、ウシ、ブタ、ニワトリ、ウマ、アルパカ、ラクダなどの家畜に加え、シロイルカ、キリン、フェレット、スンクス、コウモリ、スズメからも、それぞれの動物に固有のコロナウイルスが検出されている。
コロナウイルスの種特異性は高く、種の壁を越えて他の動物に感染することは殆どない。
電子顕微鏡で観察されるコロナウイルスは、直径約100nmの球形で、表面には突起が見られる。形態が王冠“crown”に似ていることからギリシャ語で王冠を意味する“corona”という名前が付けられた。
脂質二重膜のエンベロープの中にNucleocapsid（N）蛋白に巻きついたプラス鎖の一本鎖RNAのゲノムがあり、エンベロープ表面にはSpike（S）蛋白、Envelope（E）蛋白、Membrane（M）蛋白が配置されている（図１）。
ウイルスゲノムの大きさはRNAウイルスの中では最大サイズの30kbである。
※１００ｎｍ ＝０．１μｍ（ミクロン）
コロナウイルス画像
（https://www.niid.go.jp/niid/images/epi/corona/corona-fig1.png よりダウンロードさせていただきました）
遺伝学的特徴からα、β、γ、δのグループに分類される。
HCoV-229EとHCoV-NL63はαコロナウイルスに、
MERS-CoV、SARS-CoV、HCoV-OC43、HCoV-HKU1はβコロナウイルスに分類されている。
補足：γ、δの例については横浜市の「コロナウイルス感染症について」に紹介されてました。
コロナウイルスとは
「新型コロナウイルス（SARS-CoV2）」はコロナウイルスのひとつです。コロナウイルスには、一般の風邪の原因となるウイルスや、「重症急性呼吸器症候群（ＳＡＲＳ）」や2012年以降発生している「中東呼吸器症候群（ＭＥＲＳ）」ウイルスが含まれます。ウイルスにはいくつか種類があり、コロナウイルスは遺伝情報としてRNAをもつRNAウイルスの一種（一本鎖RNAウイルス）で、粒子の一番外側に「エンベロープ」という脂質からできた二重の膜を持っています。
自分自身で増えることはできませんが、粘膜などの細胞に付着して入り込んで増えることができます。
ウイルスは粘膜に入り込むことはできますが、健康な皮膚には入り込むことができず表面に付着するだけと言われています。
物の表面についたウイルスは時間がたてば壊れてしまいます。ただし、物の種類によっては24時間～72時間くらい感染する力をもつと言われています。
手洗いは、たとえ流水だけであったとしても、ウイルスを流すことができるため有効ですし、石けんを使った手洗いはコロナウイルスの膜を壊すことができるので、更に有効です。
手洗いの際は、指先、指の間、手首、手のしわ等に汚れが残りやすいといわれていますので、これらの部位は特に念入りに洗うことが重要です。また、流水と石けんでの手洗いができない時は、手指消毒用アルコールも同様に脂肪の膜を壊すことによって感染力を失わせることができます。
感染経路
新型コロナウイルス感染症がどのように感染するのかについては、現時点では、飛沫感染（ひまつかんせん）と接触感染の２つが考えられます。（１）飛沫感染
感染者のくしゃみや咳、つばなどの飛沫と一緒にウイルスが放出され、別の人がそのウイルスを口や鼻から吸い込み感染します。※主な感染場所：学校や劇場、満員電車などの人が多く集まる場所
（２）接触感染
感染者がくしゃみや咳を手で押さえた後、その手で周りの物に触れてウイルスが付き、別の人がその物に触ってウイルスが手に付着し、その手で口や鼻を触って粘膜から感染します。※主な感染場所：電車やバスのつり革、ドアノブ、スイッチなど
※エタノールで脂質二重膜が破壊されるのに必要な時間についての情報は得られず・・・
「ウイルス 次亜塩素酸 濃度」
次亜塩素酸水、次亜塩素酸ナトリウムがウイルスに効果があると聞き、どの程度の濃度や時間で効果があるのか、知りたかったので調べてみた。
病院感染、院内感染対策学術情報 ｜ 3）次亜塩素酸系 （ヨシダ製薬のホームページより）
次亜塩素酸ナトリウム
特徴
”手指、皮膚などへの適用も認められているが、手荒れを招く場合が多く、持続効果も期待できないので生体適用が適切な場合はほとんどない。”
”作用機序
次亜塩素酸（HClO）が主な有効成分である。水溶液中の次亜塩素酸はpH5～6付近で濃度が最も高く、これよりpHが高くなると次亜塩素酸イオン（OCl－）が増加し、またこれよりpHが低くなると塩素（Cl2）が増加する。したがって殺菌効果はpH依存性があり、あまりpHが高ければ殺菌効果が減弱するが、酸性側では塩素ガスが発生しやすいため、アルカリ側に調製された次亜塩素酸製剤が市販されている。
遊離塩素類の細胞質の破壊のメカニズムは明確にはわからないが、細胞内の酵素反応の阻害、細胞内蛋白質の変性、核酸の不活性化が作用機序として考えられている。”
強酸性電解水
厚生労働省により医療機器として認可された電解酸性水製造機器の適用は、流水式による2分間の手指の洗浄消毒と内視鏡洗浄消毒のみである。
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次亜塩素酸ナトリウム【高杉製薬】塩素系漂白剤｜製造・販売｜新型コロナウイルス｜Q&A
COVID-19（新型コロナウイルス）について、物の表面の消毒には次亜塩素酸ナトリウム（0.1％）、手など皮膚の消毒を行う場合には消毒用エタノールが有効であることが分かっています。
「有効であることが分かっている」ことは分かったが、どの程度の時間消毒していればよいのか、具体的な数値はここの情報だけでは分からなかった。
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＜追記 2020/04/24 19:20＞「新型コロナウイルス感染症 ～市民向け感染予防ハンドブック」を発刊しました | 東北医科薬科大学病院
このページ内のリンクから、4/24時点でのコロナウイルスに関する情報が「ハンドブック」（pdf形式）として入手可能。
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日本ウイルス学会
http://jsv.umin.jp/news/news200210.html
★「エンベロープ コロナウイルス」について調べているうちに出会った文献
コロナウイルスの細胞侵入機構：病原性発現との関連 ←pdfファイル
新型コロナウイルス感染症について
http://jsv.umin.jp/news/news200210.html
★一本鎖プラス鎖RNAウイルス
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』
(+)ssRNAウイルス
HCV EM picture 2.png
C型肝炎ウイルス
分類（ウイルス）
群 : 第4群（1本鎖RNA +鎖）
一本鎖プラス鎖RNAウイルス(Positive-sense single-stranded RNA virus)
★「エタノール ウイルス 作用機序」
殺菌・抗ウイルス効果に及ぼすエタノール濃度の影響
http://www.thcu.ac.jp/uploads/imgs/20190605090207.pdf
生体消毒薬の抗微生物効果と細胞毒性
https://www.thcu.ac.jp/uploads/imgs/20160711050216.pdf
ア ル コー ル 類 の ウイ ル ス不 活 化 作 用 に 関 す る研 究
エ タ ノー ル 消 毒 に お け る生 体 試 料 の 影 響
http://journal.kansensho.or.jp/kansensho/backnumber/fulltext/55/367-372.pdf
病院感染、院内感染対策学術情報 ｜ 1）アルコール系
http://www.yoshida-pharm.com/2012/text05_02/
各種微生物に対する消毒薬の選び方
https://www.kenei-pharm.com/medical/countermeasure/microbe/08.php
アルコールと殺菌の話
https://www.kao.co.jp/pro/hospital/pdf/08/08_05.pdf
★「ウィルス 除去」
★「ウイルス 次亜塩素酸 濃度」
病院感染、院内感染対策学術情報 ｜ 3）次亜塩素酸系
http://www.yoshida-pharm.com/2012/text05_02_03/
次亜塩素酸ナトリウムについて 高杉製薬
http://www.takasugi-seiyaku.co.jp/prdt/04_01.html
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花王の塩素系漂白剤で、次亜塩素酸ナトリウム0.05％、0.1％の液は作れるの？
ウイルスが心配なので、「ハイター」「キッチンハイター」を薄めた液でドアの取っ手やノブを拭いたのですが、その後水拭きが必要なの？
「ハイター」「キッチンハイター」を薄めた液を手指などの消毒に使ってもいいの？
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https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/dengue_fever_qa_00001.html
・ 風邪の症状や37.5度以上の発熱が４日以上続く場合（解熱剤を飲み続けなければならないときを含みます）
・ 強いだるさ（倦怠感）や息苦しさ（呼吸困難）がある場合
※高齢者をはじめ、基礎疾患（糖尿病、心不全、呼吸器疾患（慢性閉塞性肺疾患など））がある方や透析を受けている方、免疫抑制剤や抗がん剤などを用いている方：
・ 風邪の症状や37.5度以上の発熱が２日程度続く場合
・ 強いだるさ（倦怠感）や息苦しさ（呼吸困難）がある場合
吉田製薬 アルコール系消毒薬について
http://www.yoshida-pharm.com/2003/letter16/
アルコール類のウイルス不活化作用に関する研究 エタノール消毒における生体試料の影響
http://journal.kansensho.or.jp/kansensho/backnumber/fulltext/55/367-372.pdf
アルコールと殺菌の話
https://www.kao.co.jp/pro/hospital/pdf/08/08_05.pdf
消毒用エタノールとイソプロパノールの殺菌効果・ウイルス不活化効果の違いは？
http://www.maruishi-pharm.co.jp/med2/question-many-answer_8_3.html
野田 伸司、他：感染症学雑誌 1981；55（5）：355－65.【9418】
アルコール類のウイルス不活化作用に関する研究
ウイルスに対する各種アルコールの不活化効果について
昭和56年5月20日
https://www.jstage.jst.go.jp/article/kansenshogakuzasshi1970/55/5/55_5_355/_pdf/-char/ja
殺菌・抗ウイルス効果に及ぼすエタノール濃度の影響
薬局薬剤師が知っておくべき感染症予防対策（消毒編）
https://www.nichiyaku.or.jp/assets/uploads/activities/20200219.pdf
知っておきたい消毒薬の知識
https://www.jstage.jst.go.jp/article/naika/99/8/99_1916/_pdf
食品製造現場における衛生管理～食中毒予防の 3 原則より～
https://www.jfrl.or.jp/storage/file/news_vol3_no22.pdf
消毒薬の有用性と有害性に対する評価
http://www2.lib.yamagata-u.ac.jp/kiyou/kiyoum/kiyoum-27-2/image/kiyoum-27-2-135to146.pdf
消毒薬の有用性と有害性に対する評価
https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsei/25/2/25_2_68/_pdf
消毒剤の殺ウイルス効果に関する検討―殺ウイルス効果に及ぼす血清蛋白の影響
https://www.jstage.jst.go.jp/article/kansenshogakuzasshi1970/74/8/74_8_664/_pdf/-char/ja
Norovirusの代替指標としてFeline Calicivirusを用いた手洗いによるウイルス除去効果の検討
https://www.jstage.jst.go.jp/article/kansenshogakuzasshi1970/80/5/80_5_496/_pdf/-char/ja
『新型コロナウイルス感染爆発のカラクリ』
https://ameblo.jp/nomadodiet/entry-12587612664.html
緊急寄稿（1）新型コロナウイルス感染症（COVID-19）のウイルス学的特徴と感染様式の考察（白木公康）
https://www.jmedj.co.jp/journal/paper/detail.php?id=14278
新型コロナウイルス感染症 感染症学会
http://www.kansensho.or.jp/modules/topics/index.php?content_id=31
★実効再生産数
新型コロナウイルス感染症対策の状況分析・提言（2020/5/1） 新型コロナウイルス感染症対策専門家会議
https://www.mhlw.go.jp/content/10900000/000627255.pdf
新型コロナウイルス感染症対策専門家会議「新型コロナウイルス感染症対策の状況分析・提言」（2020 年 5 月 1 日）
https://www.mhlw.go.jp/content/10900000/000627254.pdf
感染症数理モデル；Sequential SEIR model
新型コロナウイルスに関する一考察（1）：重要な3つの変数「基本再生産数」「致死率」「今後の死亡者数の月次推移」
https://www.rieti.go.jp/jp/columns/a01_0568.html
★厚生労働省 インフルエンザ 死亡者
Q10.通常の季節性インフルエンザでは、感染者数と死亡者数はどのくらいですか。
https://www.mhlw.go.jp/bunya/kenkou/kekkaku-kansenshou04/02.html#100
インフルエンザの発生状況
https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/kenkou/kekkaku-kansenshou01/houdou.html
吉野敏明医師
https://www.facebook.com/toshiaki.yoshino.9?__tn__=%2CdC-R-R&eid=ARCcKz3do_Aul2Uj-5z44gei1TtaD3CAFLP1GZHDAAgxv6ZyUVckhWFpc_QpbmFQH8QbrPaD4B5sDsJA&hc_ref=ARRWGoD_fayDm5sJA1FACTcwA4B-RTb3CMpAby9gxJEWS3N5KEyhD7PhnM_cytiYTqg&fref=nf
★コロナ 人工呼吸器
https://gemmed.ghc-j.com/?p=33302
https://www.businessinsider.jp/post-211963
https://www.asahi.com/articles/ASN4K6D83N4KUPQJ00M.html
★人工呼吸器 つけると
★人工呼吸器を外すとき
みんなの介護コミュニティ 人工呼吸器を付けたら外すことはできるの？
https://www.minnanokaigo.com/community/C18941954/
https://www.asahi.com/articles/ASN4K6D83N4KUPQJ00M.html
https://www.kango-roo.com/work/5640/
人工呼吸器 意識のある患者にとっては堪え難い苦痛
https://www.news-postseven.com/archives/20160826_440569.html
「コロナウイルス エタノール 濃度 時間」で検索
【 アルコール（エタノール）】の濃度による殺菌（除菌・消毒）効果について｜地の塩社
新型コロナウィルスへの不活性効果
2020年4月17日に北里大学 大村智記念研究所 ウイルス感染制御学研究室Ⅰ 片山和彦教授らの研究グループが市場に流通している医薬部外品・雑貨のうち、主にエタノール、界面活性剤成分を含有し、新型コロナウイルスの消毒効果が期待できる市販製品を対象に、新型コロナウイルス不活化効果を有する可能性について、試験管内でのウイルス不活化評価を実施したプレスリリースを発表した。
この研究によると濃度50％以上のエタノールに、接触時間1分間で十分な新型コロナウイルス不活性化が可能
アルコールの除菌メカニズム
アルコール（エタノール）は、生体膜を透過する一方、中程度の濃度（40％）以上では両親媒性を持つために、細胞膜など脂質膜やタンパク質を変性させる生理作用があります。（細胞膜が壊れ、穴があき、細胞内容物が漏れ出てくる）
原核生物である細菌などに作用すると、タンパク質の変性や溶菌などの殺菌作用があります。
また、ヒトなどの局所作用として収れん作用が現れます。
つまり、ある程度水が存在する状況では、アルコールが膜を変性すると共に、透過したアルコールなどが菌の内圧を高め溶菌などの作用があります。
一方、高濃度ではタンパク質の構造水などの脱水作用が生じるため、変性作用が強く現れます。
（アルコール度数が高い物は、脱水作用により細胞膜など外膜に対して浸透圧による外圧が加わり、溶菌作用を減弱させるように作用）
※詳細なメカニズムはいまだ解明されていません。
論文・研究結果からの考察
あらゆる菌・ウイルスに対して、殺菌（除菌・消毒）を行うという観点では、日本薬局方が定める76.9～81.4 v/v%が必要であるが、
63v/v%の濃度があれば、一部の菌・ウイルスを除き十分な殺菌効果が期待できます。
また濃度の高いアルコールを使い続けると、手荒れが進み菌が滞在しやすくなるため、
アルコール除菌と併用して、ハンドクリーム等でのハンドケアが大切です。
↑の記事内のリンクをたどると
医薬部外品および雑貨の新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）不活化効果について（北里研究所）
※ようやく具体的な数値に出会えた！ エタノールに１分間接触！ けっこう長い。
【新型コロナウイルス】消毒用アルコールが不足 家庭で入手できる洗剤やエタノールでも十分な消毒効果がある | 最近の関連情報・ニュース | 一般社団法人 日本生活習慣病予防協会
コロナウイルスの消毒薬感受性について（ヨシダ製薬）感染対策情報レター2020/04/21
現時点（2020年4月1日現在）で新型コロナウイルスに対して消毒薬感受性を検討した報告はありませんが、コロナウイルスはエンベロープを有するウイルスであり、消毒薬抵抗性は高くないと推察できます。
コロナウイルス科の類縁ウイルスも含めたコロナウイルスの消毒薬感受性から推察すると高水準消毒薬（グルタラール、フタラール）および中水準消毒薬（次亜塩素酸ナトリウム、ポビドンヨード、エタノール、イソプロパノール）は有効であると考えられます。
一方で低水準消毒薬（クロルヘキシジングルコン酸塩、ベンザルコニウム塩化物）については十分な効果が得られない可能性があります。
フレイルとは何かを知って、介護予防
https://kaigo.homes.co.jp/manual/healthcare/flail/
感染者累計の推移
朝日新聞 新型コロナウイルスの感染状況
新型コロナウイルス感染者数の推移がグラフで見れる。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32035997/
